'n Elektroforesestelsel bestaan uit twee hoofkomponente: 'n Kragtoevoer en 'n Elektroforesekamer. Die kragtoevoer verskaf krag. Die "krag", in hierdie geval, is elektrisiteit. Die elektrisiteit wat van die kragtoevoer af kom, vloei, in een rigting, van die een kant van die elektroforesekamer na die ander. Die katode en anode van die kamer is wat teenoorgestelde gelaaide deeltjies aantrek.
Binne die elektroforesekamer is 'n skinkbord - meer presies, 'n gietbak. Die gietbak bestaan uit die volgende dele: glasplaat wat in die onderkant van die gietbak gaan. Die gel word in die gietbak gehou. Die "kam" lyk soos sy naam. Die kam word in gleuwe aan die kant van die gietbak geplaas. Dit word in die gleuwe gesit VOORDAT die warm, gesmelte jel gegooi word. Nadat die jel gestol het, word die kam uitgehaal. Die "tande" van die kam laat klein gaatjies in die jel wat ons "putte" noem. Putte word gemaak wanneer die warm, gesmelte jel om die tande van die kam stol. Die kam word uitgetrek nadat die jel afgekoel het, wat putte laat. Die putte bied 'n plek om die deeltjies wat jy wil toets te sit. 'n Persoon moet baie versigtig wees om nie die gel te ontwrig wanneer die deeltjies gelaai word nie. Om die gel te kraak of te breek, sal waarskynlik jou resultate beïnvloed.